猫を連れて結婚し、育児経験がある者です。

今のネコさん「なにやらうごめくものがいる。オギャーオギャーと変な声がする。ママは変なにおいがして、本当にママなんだろうか？」　イライラして仕方がないのでしょう。
今まで室内飼いで、ご夫婦としか接していないのではありませんか？
そうした場合、甘えんぼな子ほど、排他的になります。もちろん個性もありますが。
我が家の猫も私と部屋暮らしでしたので、子猫ですら威嚇して、もう一匹ということはかないませんでした。部屋は愛猫にとって自分のテリトリーだったのです。

おそらく困りママさんのねこさんも、いきなり自分のテリトリーに知らないものが入ってきて怒っているのでしょう。
その上、ママは大嫌いな知らないもののにおいがするので、以前のママじゃない。
いきなり環境が変化して、その上今までのようにかまってもらえないし、行動範囲も制限される。怒り、戸惑い、不安、恐怖でイライラとして、自分でも戸惑っていると思います。
ネコさんも若いので、血気盛ん。これが年をとると、いい加減おっとりするものですが。

我が家の場合は、愛猫（避妊済み）も１０歳になっていましたので、帰宅した時にまずはめいっぱい抱きしめて、しばらくいない間の分かわいがりまくってから、「新しい家族よ。めんどうみてね」と見せましたら、メスのせいもあったのでしょうがそのまま受け入れました。
この猫はかなり神経質できつい性格で、私以外の人間がいると隠れてしまうような子でしたが、不思議と子供だけは受け入れましたね。そばに行って添い寝をしていました。

ただ、私も以前どおりの生活ができるように、赤ん坊ができたからと猫の立場が変わらないようにと、気をつけました。そばに来た時は、かまってほしいのだろうと、たとえほんのわずかな時間でも抱き上げてなでてやりました。ご飯がほしいと来れば、子供が泣いていても、猫のご飯が先です。そうして「今までと変わりないんだ」と、猫も納得していった気がします。
現在ウサギを飼っていますが、犬でも猫でも、先住のものを先にするというのは、新しい家族を加える時の大前提です。

とはいえ、すでにネコさんはシャーフーになってしまっていますので、まずは赤ちゃんが見えない距離にして、赤ちゃんの気配から遠ざけてください。
そしてできればネコさんをかまう時には、手を洗ったり服を着替えたり（できれば以前着ていたものがいい。つまり、赤ちゃんのにおいがついていないもの）して、以前と同じママなんだと分かってもらえるようにしてみてください。
またじっくりとネコさんの目を見ながら「あなたが大好きよ。いい子ね。ちょっとうるさいけど、我慢してね。」と静かに話す事も大事だと思います。
それを繰り返してもネコさんが落ち着かない場合は、しばしご主人にバトンタッチして、まずはネコさんに落ち着いてもらうことからはじめてはどうかな？と思います。

これをすれば何とかなるということは、正直分かりません。
ただネコさんがどんな精神状態なのかを理解して、そのストレスを軽減する努力をしてあげることが解決につながると思います。
そうしたことを続ければ、あとはけりーずはうすさんのおっしゃるように、時間が解決するのではないかと思います。

それでもどうしてもお怒りモードが解けない場合。もしも避妊をしていないならば、ひょっとして避妊手術をすると、多少穏やかになる可能性もあるかもしれませんね。このあたりは、獣医さんにご相談くださいね。