消毒液としては、うがい用のイソジンでよいと思います。
しかし、イソジン液をつけても、すぐ水に戻すと殆ど意味はありません。
ＧＯさんが言われているように、半日以上乾かしておくと良いと思います。

まあ多くの場合、キレイな水で飼育飼育していれば問題はないと思います。
このキレイな水という解釈も面倒くさいのですが、少なくとも砂利などの
アクセサリーなどは入れず、毎日しっかり水を取り返り、ケースも洗いう
などでしょうか。

多頭飼育に関してはＧＯさんがすでに言われています。
尾を食べられにくくするためには、飼育ケースを黒などにすると明るい色の
ケースで飼うより明らかにそのキケンが低下します。
ただし、これからの季節そのケージを直射日光に当てると、思った以上に
水温が上がってしまうので注意してください。

ＧＯさん
いいですねー。房総ですか。
もう何十年も房総に行かなくなりましたが、アルダブラがいるテーマパーク
があるのですね。
こちらでもめっきり温かくなり、カメを外に出したり入れたり大変です。
２階からいっぺんに何匹かを籠に入れて運ぶのですが、数回の往復が必要で
場合によっては１０ｋｇ近くなってしまいます。
出しっぱなしで良い季節に早くなってほしいものです。
それにしても、晴れていれば勿論、曇っていても本当にカメたちの目が
生き生きと楽しそうで、まあ、この苦労も仕方がないかな？