若いうちに避妊手術をしてもらって、猫チャンも幸せですね。
猫の場合は犬と違って乳腺腫瘍のうち悪性（癌）の割合が高いですし、
また、避妊手術のを行なっている猫は行なっていない猫より乳腺腫瘍の
発生率が1/7になりますので、きっと長生きされることでしょう。

さて、質問の「ハゲ」の件ですが・・・。
前足のハゲは多分、麻酔中に点滴を行なうため、針を血管の中に刺したまんまに
しなければないので、そのときの毛刈りの後と思われます。
何もご心配することはありません。
後ろ足の付け根とわき腹の「ハゲ」は、前足と比べてどうですか？
もし同じような毛の短さ、なくなり方なら、大丈夫でしょう。
もしかしたら、心電図の電極をつける際に毛を刈られたかもしれないので
赤くなってる、四六時中かく、かさぶたのようなものがついている、
そこだけフケがおおいなどの症状がなければ大丈夫だとおもいます。
糸についてですが、できれば皮膚の表面にでている糸は切ってもらったほうが
いいと思います。ただ、主治医の先生が大丈夫だといっているのであれば、
心配いらない程度ではないのでしょうか。
手術部位の腫れは、病的なものと生理的（傷を治そうと細胞があつまってきたり
皮膚の下を縫っている糸を溶かそうと細胞があつまってきたり）なものがあります。
薬が処方されているのであれば、それを飲ませ様子を見て、異常があったら
すぐに獣医師に連絡をとる、そのような方法でいいと思います。