くまこさん、お困りのようですね、
獣医でない私にお答えできる範囲でのことです、よろしければ参考にして下さい。

　*ネフライザはうさぎに苦痛では？
　　--鼻でしか呼吸ができないうさぎにとって、苦痛はあるかもしれません。
　　　この治療をするにあたって獣医先生とよく話し合われましたか。
　　　あなたの不安を取り除いてくださるお答がありましたか。
　　　これは私の予想ですが、獣医先生はネフライザでの治療からもたらされる、
　　　利点と、そうでない点を比べて、利点をお取りになったのではないかと思います。
　　　
　　　使われている薬は、なんでしょう。
　　　吸入に用いる薬も食塩水の様な物から始まって、いろいろあります。
　　　肺のどういうことに効くのでしょうか。
　　　ネフライザは、霧になった薬が肺にはいって、薬を肺の隅々に行き渡らせることができます。
　　　飲み薬や、注射では薬が効き始めるまでに時間がかかります。
　　　それにくらべて、ネフライザは、直接薬を肺にいれますから、
　　　有効な治療法と私は考えます。
　　　ただ、これは人を前提にしている考えで、うさぎは体や肺の構造上どうなのかは
　　　私にはよくわかりません。
　　　薬の種類によっても、苦痛の度合いは違ってくるでしょう。
　　　また、治療する時間が長いか短いかによっても、苦痛は違うでしょう。
　　　あなたのうさぎの場合膿が肺に入っていることが原因でこの治療を使っていらっしゃっるのでしたら、
　　　うさぎに合った、時間と薬の濃度、が守られていれば、うさぎは少しは楽になると思うのです。

　　　
　*他の動物でも使われているか？
　　--私は鳥の場合しか知りませんけれど、
　　　あなたのうさぎと大体同じ方法で治療していました。
　
　これぐらいの事しか書けませんが、参考になるでしょうか。
あなたのうさぎさんが苦痛のない日々を送られますよう願っています。
ネフライザについての詳しい情報でしたら呼吸器専門の友人に聞いてみましょうか？