クロさんへ
最初に言っておきますが、これはその子たちの性格で決まる事で、どうしたらこうなると言う適切な返事は難しいと思います。
ただこういう事もある位の気持ちで読んで頂ければと思います。

まず子供を産んだ後の雌は子供を守るために気が強くなっていて当たり前です。雄が12歳、雌は一歳半だとお互いの信頼関係もまだ浅いと思います。
その上、他の雄猫の子供がいるからには母猫にはかなりそれまでの事情があると思います。雌の方は色々厳しい時間を過ごしてきているかもしれませんから余計きつくなる事も考えられます。
全てが安心できる環境だと納得出来ていれば、雄がいようが他の雌がいようが大丈夫な子もいます。でもこの子は怒っていると言う事はうっかりすると子供を食べてしまう事だってあります。
今回は離す事でしばらく雌の方は安心して子育て出来たのでしょう。
これから子猫は行動範囲が広くなり、また母猫はヒヤヒヤし出す事もあるでしょう。でも今後雌の避妊手術するかしないかにも寄りますが子猫が大人になってくると子猫の雄は母親と思うより雌猫と思う子が出てきます。
母猫が避妊した場合は又うるさがって威嚇したりする事もあります。
中には性格が弱い子がいて、何時までも母親にべったりする子も居ます。母親がそれを認める事もありますが、環境がかなり影響します。
避妊していなければ、今度は次の子供を作ろうとしだしますし、環境的に他の子が居ない時は親子でかかってしまう事もあります。
ここまでは雌の方から考えてみました。
さて雄の方から考えると雄の性格にも寄りますしやはり環境も影響あることですが、母猫にきついことをされた記憶プラス変な小さいモゴモゴ動いて落ち着きの無い動物が出てきて、しかも怖い事をする母猫が側についているとなれば、精神的に穏やかには出来ないでしょう。
母猫より子猫の方が先に雄猫に懐く事の方も考えられます。母親が居なければ仲良く出来るようになる事はあります。
母猫は雄猫を信頼できる相手だとこの先思ってくれるかどうかは、微妙な所だと思います。
環境が狭くて逃げ場が無い場合怒りながらも次第に許していく事も無いとは言えないでしょう。
子猫のほうが先に遊びだして、雄が怒らなければ無事上手く行くこともあります。
雄が去勢しているかどうかも又違う事が起こり得ます。
12歳の雄が今までその母猫が来るまで一匹だけで飼われていたか、絶えず外から刺激のある環境かも影響します。世慣れていれば気にしないで居られる子も居ますし、始めて他の子が来てしかも怒られて、しかも小さいものがうろうろし出したとなると、難しい事も多いかもしれません。
今後どうしたいかで又色々方法はあると思いますよ。