子猫は元気いっぱいでかわいいですよね。
家には、子猫はひとりですか？。
もしかして、違う場所でおしっこしているた形跡はないですか？。トイレに行こうとしたら、たまたまトイレが汚れてて、猫はきれい好きですから、仕方なく、違う場所でしてしまい、今もそのにおいが残ってるから、今もそこでしてしまうのではないでしょうか？。 後で気づいて、片付けが大変だった！なんてこともあります
。
おっしゃるように、まだ小さいですし、もし、母猫と一緒にいないなら、母猫にお尻をなめてもらって、おしっこやうんちをする訓練ができないから、うまくできないのかもしれません
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もし、泌尿器の病気にかかっていると（オスは特に注意）、オス、メス共に、トイレに行ってしたいけど、トイレに行くまでに、おしっこが間に合わなくて漏らしてしまうので、漏らした所に（においがついているから）引き続きしてしまっているのかもしれませんね。
トイレをいつもいる所に近づけ（例えば、寝ていることが多いなら、ベッドのそばにとか）、トイレの数を増やすと、トイレ以外にはあまりしませんので、逆に掃除しやすくなりますよ。
私は、たとえば１匹なら２個、２匹なら３個、３匹なら４〜５個が、トイレの理想の数です。
まだ小さいから、気長に、やってみられたらいいと思います。猫ちゃんは、遊ぶのに、忙しいだけだったりしてね。かわいいですね。