AKOさん、こんばんは
まず、私なりの結論から申し上げれば、
細胞診くらいはしてもらってもいいように思います。
ただ、針を刺すことがワンちゃんの性格上？非常に難しく
おできの見た目が明らかに良性っぽいのであれば別ですが...。
なお細胞診と組織検査について..
細胞診は前にも書いたように通常細い針を刺して細胞を採取し
その場（病院）でできる検査です（場合によっては標本を
専門機関・検査センターに送ることもあります）。一方、
組織検査（大義では細胞診も含まれるのかもしれませんが）は、
ある程度の塊を専門機関・検査センターに送ります。よって、
この場合は手術が必要になります。（なお おできのある部位・大きさ
そして本人の性格によっては局所麻酔でも切除できることがあります。）
診断精度は組織検査の方が上ですが、細胞診である程度のことはわかります。

AKOさんのケースでは...診ていないものが言えることではないのですが、
おできが小さく見た目に良性っぽくまた少し小さくなっているようで
あればそのまま様子をみてもいいように思います。
また ３才過ぎで後肢？のおできであれば典型的ではないですが、
若い子にできる良性の腫瘍として組織球腫というのがあります。
犬　組織球腫　で検索してみてください。
ただ、似てる！と思っても、
これだ！！とは決めつけないでくださいね。

それと、〜〜と言われた・〜〜病（症）と言われた場合、
そのことについてこういう場で相談される場合は、
その根拠となるものを教えてもらうとより現実的な回答が
できかと思います...一般論として。