他の方も言われている事ですが病院の処方食、
のあママさんの犬には体質的に合わないのではないでしょうか？
少し大きめのペットショップでないとなかなか置いてないかもしれませんが、
各フードメーカーから「低アレルギー食」という仕様のフードが一般にも販売されています。
病院の処方食は少し中断して、そちらの方を試されてみてはどうでしょうか？
「低アレルギー食」といっても、やはり個体差で体質に合わない場合もあり、
「今までＡ社のフードをあげてたけど、Ｂ社にしたら症状が緩和された。」
と言う人もいれば、
「うちは逆にＢ社が駄目、Ａ社の方が調子がいいみたい。」
と言う人もいます。
病院で処方された物が一番良い物に見えてしまいがちですが
犬の体質に合わなければ結局は処方食も良くないフードだと、私は思います。
また現在飼われている環境も考え直された方がいいと思います。
室内飼いなら外飼いに、外飼いなら室内飼いにしたり
室内でも屋外でも犬を繋ぐ場所を別の場所に変えてみたりして、
どの部屋が、どの場所が一番症状がでやすいか？などじっくり観察をされるといいと思います。
（アパートやマンションにお住まいの場合、外飼いにするのはかなり難しいでしょうが・・・）
私も環境と食物アレルギーもちの犬を屋外で飼っています。
最初の頃は食物アレルギーだけで様子を見ていたのですが、
一向に症状が良くならないので途方に暮れた時期がありました。
が、犬を繋ぐ場所を変えたら一ヶ月程かけてですが徐々に症状が緩和してきました。
「今までの苦労は一体・・・」と思うくらい、体調もかなり良くなりました。
新しいフードに切り替えたり、大々的に環境を変えたりするのはとても怖いことでしょうが、
少しでも効果が見られた時の安堵感は、それまで溜まってた悩みやストレスを発散させくれます。
と言っても、新しい症状が出てくるかもしれないので安心ばかりはしてられませんが、
試してみて損はないと思います。

手作り食とサプリメントについて。
手作り食はレシピ本が数種類出版されてますよ。本屋のペットコーナーにあると思います。
サプリメントもたくさんのメーカーからたくさんの種類が出ています。
値段も100g、2000円くらいのもあれば10000円以上するのもあります。
やはりフード同様に値段、質に関係なく個体差で効くもの効かないものがあるようです。
サプリを扱ってるペットショップなどでカタログを見せてもらったりして
のあママさんの犬に合う物をゆっくり探されるのがよろしいかと。
妊娠中のお体で犬の世話は大変でしょうが、頑張ってください。