ノミはお散歩などでつけてくるだけでなく、もともと運んできたものってこともありえますよ。
ブリーダーさんのところからきたときに卵の状態でノミを連れてきたっていう可能性もあります。
しっぽの付け根の毛をかきわけて黒い粒々(ノミの糞)がないかよく観察してくださいね。

生後3ヶ月ならもうとっくに硬いままのフードでいいですよ。
犬はだいたい生後50日くらいで乳歯が生え揃います。
その頃からふやかしたドッグフードをあげて、おなかをこわさないことを確認したら、
すぐに硬いままのフードにしちゃっていいんです。
ふやかしたものを与えるのはほんの1〜2週間でいいんです。
早い子だと生後2ヶ月、遅い子でも生後2ヶ月半でカリカリ硬いままでいいんですよ。
そのほうが、噛む→アゴを使う→乳歯から永久歯の生え変わりがスムーズですし、
噛むことで脳が刺激されて脳の発達を助けます。
ふやかしたフードの期間が長いと二重歯の原因になったりしますしね。
硬いと噛めないのでは?と心配しなくていいですよ。
犬はもともと丸飲み動物ですから、ノドを通るサイズのものなら噛む必要はありません。
しつけのご褒美のおやつは食餌のときに与えるフードの粒で充分です。
それと、ご褒美として必ず食べ物を与えるという必要もありません。
「いい子、いい子」となぜ回すほうが犬は食べ物をもらうよりうれしかったりしますもん。

またなんでも質問・相談してくださいね。