心配ですさんへ。
飲ませている薬はなんでしょうか。抗生物質ですか?　抗生物質を繰り返し使っていると耐性ができて薬が効かなくなってしまいます。それを見越して獣医さんはいずれ手術とおっしゃったのでしょうか。
いずれにせよ血尿の原因をさぐらないと今後の投薬や治療の方針も立てられませんね。尿道・膀胱・腎臓、どこからの出血なのかによって治療はまったく変わってくるはずですから。血尿の原因を突き止めるほうがいいですね。出血によって慢性的な貧血になると全身状態が悪くなってしまいます。そうなると手術が必要になっても体力がなくて手術ができないということもありえるので、早めに対処したほうがいいと思います。
攻撃性があって検査や通院・入院に不安があることは病院に相談してみてください。少しの間だけ我慢してもらって口輪をしたり、薬で軽く鎮静をかけておとなしくさせるなど、病院側もなんらかの対策をしてくれるはずです。
1日のおしっこの回数やそのときの量や出し方(出し渋ったり、痛がったりしないか)、おしっこの出口をひんぱんに舐めるなどの仕草はないか、背中を丸めておなかをかばうような姿勢はしないか等々も血尿の原因をさぐる観察要素になります。ふだんのこれらの様子を獣医さんに伝えてみてください。