Satoさん、初めまして！
６匹のハム達と暮らしている、ふーと申します。
ペレットと同時に嗜好性の高い餌を与えると、ほとんどの子はペレットを残してしまいます。ペレットやナッツ、シード類が一緒になったミックスフードではそのような事が当たり前に起こります。一見、色々入って栄養バランスも良さそうに思えますが、バランス良く食べさせるのは一番難しい餌なんです。
ハムスターにバランス良く食べるのを望むのは無理ですからね。
最初はペレットだけを与えて、それ以外はおやつとしてコミュニケーションの道具として手から与えてみるのも良いと思いますよ。

巣箱についてですが、今使われている上半分透明のものはハムスターの習性上、あまり好まれない物だと思いますよ。ハム自身が巣箱として中で落ち着くには、中は暗くないとダメでしょう。
ななえさんのアドバイスにある様に木の巣箱が基本ですね。
あとハムスターは様々な理由から巣箱が決まっていても野良寝したり他の場所にも巣を作ったりしますから、適切な巣箱を与えてあればあまり神経質にならなくても大丈夫なのですが。

飼い始めたばかりの頃は、ハムスターの仕草一つ一つが心配になったりしますが、習性を理解できると楽しいハムライフが開けますよ！頑張ってくださいね！