びぎなぁさん、お答えどうもありがとうございました。
今日検査結果と治療法を聞きに獣医さんに行きました。ウィルス性のものではないようで、細菌に合った抗生剤を処方してもらいました。今使っている目薬と併用して一週間後の再診で直っていたらいいようです。
どうも原因ですがこのＢＢＳの書き込みから察すると、もう１羽のゆきどんのおしっこが目に入った可能性が高いようです。掃除する時ふくちゃんのケージはトレイを外せる物でケージから出さないのですが、ゆきどんは大きくてケージから出さなければ掃除ができないんです（現在犬猫用９０×５５サイズのワイヤーケージを使用）で、ベランダに一緒に置いておくのですが、ゆきどんはふくちゃんが気に入らなくて結界うんちやおしっこをよくふくちゃんケージの上でするのです。部屋で遊ばせていてもゆきどんはふくちゃんケージの周りにうんち・おしっこを毎回するので、すぐに掃除したり外用トイレを置いたりしているんですが全く止める気配がありません。
これでは直ってもまた病気を繰り返す可能性が大きいです。２羽一緒に出すとゆきどんが追い掛け回してカクカクを何度もするので、ふくちゃんのストレスになるからと出さなくてもいいケージにしたのですが、同じメス同士なのにこれほど縄張り主張が強いとは思いませんでした。
このゆきどんの優位行動を止めさせる方法は無いでしょうか？　ちなみにゆきどんは元ミニレッキス・体重４キロで大きな猫くらいのサイズ、ふくちゃんは体重２キロでミニウサギ程度です。