確かに期間も長い事ですし、一緒に帰られた方が安心かと思います。
移動に際してですが、キャリーで移動されるのですよね？
プラスチックのキャリーですと、意外に熱がこもりやすいようで、ある方が車での移動でカーエアコンをつけていたにもかかわらず、病院に行くまでの数十分で軽い熱射病のようになったという経験をお話してくれた事があります。
ですので、時折キャリーの中の状態も確認なさって下さいね。
それと、新幹線では余り揺れはないかもしれないですが、キャリーの中がスカスカだと、うさぎちゃんは一生懸命足を踏ん張っている状態になります。
出来れば体を預けられるように(体が揺れないように)何かを入れてあげる方が疲れなども出ないようです。
あと、車内は涼しいかとは思いますが、いくつかの交通手段を使われるようなので、乗り換えなどもあるかと思うのですが、車内と外気温の差が結構あるのではないかと思います。
うさぎさんは夏と冬といったような季節的な気温差よりも、一日の気温差が大きい方が参ってしまうようですので、乗り換えなどの際に待ち合わせの時間があるようでしたら、保冷剤などもご用意なさるといいかと思います。
また、出来れば休憩を挟んで、お水を飲んだりさせてあげるといいかと思います。牧草なども食べれるようにしておいてあげて下さいね。
また移動して何日かは、環境に慣れるのに時間がかかるかと思います。疲れもあるでしょうから、必要以上に手を出さず、落ち着くのを待ってあげた方がいいでしょうね。
ストレスでお腹を壊したり食欲が落ちる事も考えられますので、もしお医者様が出して下さるようでしたら、食欲増進剤とか胃腸の動きを整えてくれるようなお薬もご用意されたらいいかと思います。
近所にウサギを診れる病院があるのならば、それにこした事はないですが…。

放し飼いですが、フローリングのお部屋との事。
普段はケージという事ですが、今も遊んでいる時のお部屋はフローリングなのでしょうか？
フローリングに慣れていない子だと、足がツルツル滑ってしまって自由に動けなかったり、必要以上に足に力が入ってしまって脱臼してしまう事もまれにあるそうです。
猫などと違って肉球がないですしね…。ですので、何か下に敷いてあげるといいと思います。
あと、コード類や雑誌や新聞、柱や壁紙…とにかくなんでも齧られると覚悟して、齧られて困るものは出しておかない、しまいこめないものは徹底的にガードする事です。
特にコード類は感電の恐れもありますので、充分にご注意下さいね。

今思いつくのはこんなところでしょうか…
まだ日数もあるようなので、また思いついたら書いておきますね^^;