お尻を振るとは、横にでしょうか？前後にでしょうか？
もし前後なら、ウサ飼いさんが「カクカク」というマウンティング行動ですが、２ヶ月ではまだ少々早い気もします。(でも発育が良い子なら、するかもしれませんね）
マウンティングは、女の子でもしますよ。
もし腰というより、しっぽやお尻を振るような感じならば、「うれしい♪」というサインの事もあります。見ていて「気分がルンルン♪」という感じなら、「うれしいなサイン」かもしれませんね。
ウサギさんの行動を見るときは、一点だけを見るのではなく、目や耳の様子、体全体の力の入り具合なども見てくださいね。表情がやわらかく、目がキラキラしていて、リラックスしているなら、病気というより、感情表現の事のほうが多いですよ。
また、飼い主が何かしてあげた時にするのか、何もしなくてするのか、特定の場所やものでするのか等、もう少し気をつけて観察してみてくださいな。
エンセに関しては、先代が抗体検査をしていないのなら、なんともいえません。
母子感染もありますから、元々持っている事もありますし。
先代の疑惑を考えるなら、ゲージは漂白剤や殺菌剤で消毒し、良く流水ですすいで、日光消毒がてら良く干すことが大事です。特にゲージの隅などは、念入りに。
それでもご心配な時は、獣医さんにご相談くださいね。