まあ、このへんになると、おおむねリーズナブルな幅の中で、各個人がどのへんを「ほど」と思うか、でしょうね。

　特に「病原性が強い微生物がいる可能性」の中の、「強い」と「可能性」の評価・・・
　字義通りとってしまうと、土に触れさせることもできなくなってしまいます。破傷風菌がいる可能性がありますから・・・
　病原性・予防可能性・治療可能性・接触濃度ｅｔｃについて、定量的な判断が不可能な中でどう割り切るか、最後は感覚的なものになるのかもしれません。感覚的には、私も、水ガメの飼育水には相当な不潔感を感じるわけでとこまだしよさんの目安に一定の賛意を表するものですが、じゃあ、カメがすんでいるドブ川で泥としぶきをはね散らかして（口にも入るでしょう）遊ぶを止めるべきか、というと・・・
　掘ってきたミミズを針につけた手を口にやるとか、馬糞牛糞で生まれたハエが計ってくる中で何か食べるとか、飼育しているカメに触った手を口にやるのとあまり変わらないリスクが潜在する行為はいくらでもあり、全部を禁止もしてられんなあとも思います。
　まあ、最初は気をつけているがだんだんいい加減になっていく（それに反比例して抵抗力もついていく）ぐらいでいいのかもしれません。ただ、世の親御さんがたの傾向として、本人が清潔志向が強いようなので、どちらかといえばタフネスを強調したいのです。感染症の怖さのほうはあちこちで強調されていますが、それを恐れるあまりのデメリットは注目されることが少ないですから。