それらしい枠組みだけ作ってペーパー上のつじつまは合わせるが運用実態は、サテ・・・というのはお役所の得意技ですし。
　一度ざっと調べたことがありますが、「業」「業務」の定義はどうも法律ごとにバラバラです。税法がらみの生業はお金の出入りが問題になりますし、他方、クルマの運転は趣味でも業務となるように。
　パスポートの申請書類なんか、ウラとオモテで「署名」の意味が異なりますから（自筆による誰にでも読めるべき記名ｖｓまねされにくくあるべきサイン）、部署や役所が異なれば、語義の統一はそりゃあ期待しても無理というものかと思います。

　さらには、爬虫類のブリーダーがどういうものなのか、役人にはおぼろげなイメージすらないでしょうから、ますますピントはずれになっていくのではないでしょうか。もともとからして、畜産、水産との統一もされていないわけですし、線引きにしても、業態なのか対象種なのかあいまいですし（食用とペット用の両方とか、食用／飼料用両方の出荷がある場合とかどうなるでしょうかね？）

　なお、フリマの売り上げも課税はされると思いますよ。コミケにマルサが入って云々、ということもありましたし。