たぶん、検討はなさっているとは思いますが、いずれ親子ともども避妊および去勢手術をすることが必要でしょうね。

母猫のほうは、しばらくは外に出たがるとは思いますが、いずれあきらめるようになるでしょう。
子猫は最初から室内しか知らなければ、外への欲求は、発情を伴う時期に大きくなる程度でしょう。
マンションでネコを飼う場合色々と工夫できますよ。
・ベランダに２−３階建ての大きな猫用ケージを置き外を眺めたい時はその中ですごさせるようにする。
・窓の近くにネコが座れるスペースを用意して、天気の悪い時はそこからながめられるようにもする。
・キャットタワーや２ｍ前後の大きな家具の間を板で渡したりして、猫が３次元（高さ）を利用した遊びが出来るようにしてあげる
などです。


また、爪とぎに関しては、キャットタワーを使用すれば、それを爪とぎに利用するようになることが多いようですが
対処としては爪カバーが販売されています。これはナイロン製で、安全なボンドで爪に張ることで
爪とぎをしても、家具を傷つけないという工夫が出来ます。
ただし、爪が古いものをはぐ時に同時にこのカバーが抜けますので、２−３週間間隔で新たに装着する必要があるのが欠点です。

どうしても、困るというであれば、爪除去手術というのがありますが、これは手術後大変な痛みを伴うことですので
あまりお勧めはしません。

また、猫は単独行動を好む動物ですので、いくら兄弟、親子でも、半端じゃなく仲が悪くなることもあるようです。
（逆に、他人猫同士がいつも一緒にいるような仲がよいこともありますね。）
その理由として、スペースに合った猫の数というのも大切です。
例えば、ワンルームの部屋にはたぶん３匹以上はお互いがストレスに感じる状態かもしれません。
そのあたりもご検討なさった方がいいでしょう。