ウイルスの進化の要因には２つのパターンがあります。
１：（マクロ進化）
　　例えば、或る生物にとって致命的なウイルスが出現す
ると、その生物は
　　絶滅に向かいますね。それは、そのウイルスの絶滅も
意味します。
　　何故なら、そのウイルスにとって、その生物は宿主だ
からです。
　　もし、２０００年前にＨＩＶウイルスが出現していた
ら人類と
　　ＨＩＶウイルスは絶滅の危機に瀕していたかもしれま
せん。
　　つまり、見方を変えれば、「進化」と呼ぶべきなの
か？？？
　　どこかで、宿主（生物）と、共存できる形が進化と呼
ぶならば。。。
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２：（ミクロ進化）
　　上記のように、全ての進化がマクロ的な進化ばかりだ
と、環境の変化や
　　宿主絶滅が自らの絶滅に、即、直面する可能性があり
ますね。
　　そこで、重要な役割を担うのがミクロ進化です。
　　その主な一つが「変異」というものです。
　　そして、環境に適した「変異」進化したものが生き残
る仕組です。
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さて、「変異」について理解していただいたところで、
詳細は相当、専門的になってしまいますので割愛します
が、
ウイルスにはＤＮＡ型とＲＮＡ型があります。
皆さんも、御存知かもしれませんがＤＮＡは２重螺旋構造
なので、大変、
安定していて、修復機能もあります。同じ形を伝えてゆく
という事は
生物の子孫継続には相当に重要な事です。
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一方、ＲＮＡ型というのは、大変、不安定なのです。
ＲＮＡ型ウイルスというのは大変、不安定で「変異」が出
来やすいのです。
しかも、ウイルスは自己複製のスピードが、ものすごく早
いので、
その分、「変異」のスピードも猛烈です。
当然、時として人類や他の生物にとって重大な意味をもつ
ウイルスも出現する場合があります。
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実は、ＨＩＶウイルスもインフルエンザウイルスも
ＲＮＡ型ウイルスなのす。
第一次世界大戦の時に流行したスペイン風邪は
数千万人の命を奪いました。
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つまり、現代医学の常識からいえば、ウイルスの進化は、
抗生物質と何ら関係している訳でもないし
今回の新型インフルエンザにしても、それはＲＮＡ型ウイ
ルスの
性格みたいなものであって
人間が事の発端に関係している訳でもないのです。
こんな感じの回答でよろしいでしょうか？
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余談ですが、１９２５年位まで世界中で流行した
「嗜眠性脳炎」もウイルス説があります。
何故か、その後、世界中から消滅したらしいのです
が。。。
それを題材にした「レナードの朝」という映画は
主演ロバートデニーロの名演技もあって、
御薦めの作品です。